2019年6月6日上午,美国密苏里大学许东教授应吉林大学计算机科学与技术学院邀请,在计算机楼A521作了题为“Image Understanding of Figures in Biomedical Literature”的学术报告。
许东教授自北京大学获得学士及硕士学位后,于伊利诺伊大学厄本那-香槟分校获得博士学位,在美国国家癌症研究所完成博士后研究,曾在橡树岭国家实验室工作,2003年至今在美国密苏里大学计算机系任系主任。许东教授从事生物信息学、生物医学和人工智能领域研究逾20年,研究方向包括机器学习在生物信息学中的应用、蛋白质结构预测、生物信息分析等,在Nature, Proceeding of the National Academy of Science(PNAS), Bioinformatics等权威学术期刊发表学术论文300余篇。许东教授在2001年获得美国“最杰出研究与开发100人奖励(国际2001R&D 100 Award)”奖,2003年获联邦实验室联合会最杰出技术转让奖,2010年获国际智能生命医学协会杰出成就奖,在2015年被选为美国科学促进会会士。
在本次报告中,许东教授首先介绍了生物医学文献的文本表征和通路图表征的优缺点,虽然通路图往往包含了对分子机制的更直接的表征,但目前还没有系统的方法对通路图进行整理。其次,许东教授介绍了他们团队提出的路径管理处理策略,以捕获图中路径实体的位置、名称和相互作用。在报告的最后阶段,许东教授展望了接下来的工作方向,把他们的方法与文本编辑工具结合起来,丰富提取的信息,全面重构通路机制。
最后,许东教授悉心解答了大家提出的问题,欧阳继红副院长进行了总结。本次报告受到了广大师生的热烈响应,让大家对机器学习的应用有了进一步的了解与思考。