6月20日上午,美国印第安纳大学与普渡大学印第安纳波里斯联合分校(IUPUI)助理教授,吉林大学校友王珏鑫教授,以“Exploring Spatial Omics with Machine Learning”为题,应邀在吉林大学王湘浩楼进行计算机专家讲座。吉林大学软件学院副院长周柚教授主持讲座。
讲座中,王珏鑫教授从生物信息学的基础研究数据来源入手,用水果的不同组合状态,形象的解释了不断更新的RNA测序技术:Bulk RNA-seq、scRNA-seq和Spatial omics测序。随后,王珏鑫教授介绍了他的近期工作:针对scRNA-seq的dropout event的scGNN框架,迭代至今已到3.0版本;从可视化中观测到规律的 BSP、scBSP算法,可以快速、高通量的识别出SVG;使用EGNN的REGNN算法,在肾脏异质性组织架构分析中展现出巨大的潜力和优势,为肾脏疾病的研究和治疗提供新的思路和方法;通过问题分解,使用TrimNN算法计算子图在图中的重复性问题,探究了motif与组织功能的关系。王老师认为,在生物领域,尤其是人类对于自身的认识上,目前的研究还很浅薄,生物信息学中仍然有广阔的探索空间。
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在提问环节,师生围绕EGNN、子图重复性问题以及LLM应用等方面展开讨论,王珏鑫教授结合自己对相关问题的认识和研究,既有深度又有广度的与同学、老师进行了交流。
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本次活动的主办单位有吉林大学计算机科学与技术学院、吉林大学软件学院、吉林大学计算机科学技术研究所、符号计算与知识工程教育部重点实验室、仿真技术教育部重点实验室、网络技术及应用软件教育部工程研究中心、吉林大学国家级计算机实验教学示范中心。